This is a Demo Server. Data inside this system is only for test purpose.
 

Comparison od side effects of anti-cancer drugs in 2D and 3D and, classical and cell-on-a-chip cultures

dc.contributor.advisor Pesen Okvur, Devrim en_US
dc.contributor.advisor Çağır, Ali en_US
dc.contributor.author Kankale, Deniz
dc.date info:eu-repo/date/embargoEnd/2019-08-26
dc.date.accessioned 2023-11-13T09:43:37Z
dc.date.available 2023-11-13T09:43:37Z
dc.date.issued 2016-07
dc.department Mathematics en_US
dc.description Thesis (Master)--Izmir Institute of Technology, Biotechnology, Izmir, 2016 en_US
dc.description Full text release delayed at author's request until 2019.08.26 en_US
dc.description Includes bibliographical references (leaves: 68-74) en_US
dc.description Text in English; Abstract: Turkish and English en_US
dc.description xiii, 74 leaves en_US
dc.description.abstract The studies that aim to assess the effects of drugs developed against cancer at the cellular level use multiwell plates. However, these classical systems fail to reproduce the in-vivo like microenvironment necessary for realistic assessment. In addition, classical cell culture systems use high amount of materials increasing cost. On the other hand, lab-on-a-chip systems use minimal volumes of reagents and more importantly can mimic the in-vivo microenvironment via spatial and temporal control. Furthermore, it is known that cell response to drugs can be very different in 2D and 3D cell culture setups. Doxorubicin is a widely used anticancer drug. Here, doxorubicin uptake by highly metastatic human breast cancer cell line MDA-MB-231 and normal mammary epithelial cell line MCF10A were investigated using 2D and 3D, classical and cell-on-a-chip cultures. Drug uptake at 24, 48 and 72 hours various concentrations of the drug determined by measuring signal intensities from fluorescence microscopy images of cells. For cell viability assay, cells were stained with dapi and two cell lines were compared in systems. According to results, it was observed that 3D cell culture environment in chip provides more in-vivo like environment with less reagent consumption and cell viability is not correlated only with drug uptake. en_US
dc.description.abstract Kansere karşı geliştirilen ilaçların etkilerinin incelenebilmesi için hücresel düzeyde yapılan çalışmalar çoklu kuyucuklar kullanılarak yapılmaktadır. Ancak bu klasik sistemler gerçekçi denemeler için gerekli in-vivo benzeri mikroçevre oluşturmakta başarısız olmaktadırlar. Ayrıca klasik hücre kültürü sistemleri artan maliyetlerle yüksek miktarda malzeme kullanmaktadır. Diğer yandan çip-üzeri-laboratuvar sistemleri minimum reaktif hacmi kullanmakta ve daha önemlisi in-vivo mikroçevreyi boyutsal ve zamansal taklit edebilmektedir. Dahası hücrelerin ilaca karşı karşılıklarının 2B ve 3B hücre kültürü denemelerinde değiştiği bilinmektedir. Doksorubisin yaygın olarak kullanılan bir antikanser ilacıdır. Bu çalışmada, yüksek oranda metastatik insan meme kanseri hücre hattı MDA-MB-231 ve normal meme epitel hücre hattı MCF10A tarafından ilaç alımı 2B ve 3B, klasik ve çip-üzeri-hücre kültüründe araştırılmıştır. Farklı ilaç dozlarının 24, 48 ve 72. saatlerde alımı hücrelerin floresan mikroskobundaki resimlerinden sinyal yoğunluğu ölçülerek hesaplanmıştır.Hücre canlılığı analizi için hücreler dapi ile boyanmış ve iki hücre hattı bu sistemler içerisinde karşılaştırılmıştır. Sonuçlara göre, çip içerisindeki 3B hücre kültürü ortamın daha az reaktif tüketimiyle birlikte daha çok in-vivo benzeri ortamın sağladığı ve hücre canlılığının sadece ilaç alımıyla orantılı olmadığı gözlenmiştir. en_US
dc.description.sponsorship The Scientific and Technological Research Council of Turkey for financial support (231M668) en_US
dc.identifier.citationreference Kankale, D. (2016). Comparison od side effects of anti-cancer drugs in 2D and 3D and, classical and cell-on-a-chip cultures. Unpublished master's thesis, İzmir Institute of Technology, İzmir, Turkey en_US
dc.identifier.uri http://standard-demo.gcris.com/handle/123456789/5113
dc.institutionauthor Kankale, Deniz
dc.language.iso en en_US
dc.publisher Izmir Institute of Technology
dc.relation.publicationcategory Tez en_US
dc.request.email denizkankale@gmail.com
dc.request.fullname Deniz Kankale
dc.rights info:eu-repo/semantics/openAccess en_US
dc.subject Anticancer drugs en_US
dc.subject Cancer drugs en_US
dc.subject Doxorubicin en_US
dc.subject Cell-on-a-chip cultures en_US
dc.subject Breast cancer en_US
dc.title Comparison od side effects of anti-cancer drugs in 2D and 3D and, classical and cell-on-a-chip cultures en_US
dc.title.alternative Kansere karşı ilaçların yan etkilerinin 2B ve 3B, klasik ve çip-üzeri-hücre kültüründe karşılaştırılması en_US
dc.type Master Thesis en_US
dspace.entity.type Publication

Files

Collections