This is a Demo Server. Data inside this system is only for test purpose.
 

Evaluation of biophysical aspedts of cancer using lab-on-a chip devices

dc.contributor.advisor Pesen Okvur, Devrim
dc.contributor.advisor Sürmeli, Nur Başak
dc.contributor.author Tahmaz, İsmail
dc.date.accessioned 2023-11-13T09:08:11Z
dc.date.available 2023-11-13T09:08:11Z
dc.date.issued 2019-07 en_US
dc.description Thesis (Master)--Izmir Institute of Technology, Biotechnology, Izmir, 2019 en_US
dc.description Includes bibliographical references (leaves: 44-49) en_US
dc.description Text in English; Abstract: Turkish and English en_US
dc.description.abstract Breast cancer metastasis is really crucial point from cancer related deaths. As cancer cells from primary tumor are travelling through blood, they hang on to blood vessel and finally they exit from blood vessel into secondary site where is extracellular matrix and/or tissue/organ. This process commonly known as extravasation. Cancer cells sometimes can be highly aggressive when it exposed to hypoxia referred low oxygen amount by activating HIF1α. This transcription factor is activated in malignant cells, normal cells and endothelial cells in blood vessel when oxygen amount decreased to certain levels and it induce several genes expression such as VEGF, LOX, Angiopoietin-like-4 etc. In this study we investigated effect of HIF1α which is hypoxia indicator on breast cancer extravasation by comparing to normal oxygen level. This study represents both anemic hypoxia physiologically and lead to understand underlying mechanism of extravasation into extracellular matrix related to low oxygen circulating through blood. In addition to HIF1α effects, dynamic perfusion mimicking blood flow was applied to determine effects on extravasation. For this purpose, lab-on-a chip device was utilized for real time visualization. In conclusion, although hypoxia is giving permission MDAMB231 to extravasate because of reshaping of vascular geometry, less extravasated cancer cells observed in matrix during hypoxia under both static and flow condition when compared to normoxic and static conditions. Moreover, it was shown that flow triggers extravasation distance in normoxia against static condition and normal breast epithelial cells extravasated away in hypoxia comparing breast cancer cells by means of flow. en_US
dc.description.abstract Meme kanseri metastazı kanser ilişkili ölümlerden dolayı gerçekten çok önemlidir. Birincil tümörden gelen kanser hücreleri kan damarında dolaşırken kan damarına tutunur ve son olarak kan damarından hücre dışı matriks ve / veya doku / organ olan ikincil bölgeye çıkarlar. Bu süreç genellikle ekstravazasyon olarak bilinir. Kanser hücreleri düşük oksijen seviyesini temsil eden hipoksiye maruz kaldıklarında bazen HIF1α'yı aktive ederek oldukça saldırgan olabilirler. Bu transkripsiyon faktörü, oksijen miktarı belirli seviyelere düştüğünde hem kötü huylu hücrelerde, hem normal hücrelerde hem de kan damarının fizyolojik yapısında bulunan endotel hücrelerinde aktifleşir ve VEGF, LOX, Angiopoietin benzeri-4 gibi çeşitli genlerin ifadesini teşvik eder. Bu çalışmada hipoksi göstergesi HIF1α 'nın normal oksijen seviyesine göre meme kanseri ekstravazasyonu üzerine etkisini araştırdık. Bu çalışma hem anemik hipoksiyi fizyolojik olarak temsil etmekte hem de kanda dolaşan düşük oksijene bağlı hücre dışı matrikse ekstravazasyonun altında yatan mekanizmanın anlaşılmasına olanak vermektedir. HIF1α etkilerine ek olarak, ekstravazasyon üzerindeki etkilerin belirlenmesi için kan akışını taklit eden dinamik perfüzyon akışı uygulandı. Bu amaçla, gerçek zamanlı görüntüleme için yonga-üstü-laboratuvar aygıtı kullanıldı. Sonuç olarak, hipoksi damar geometrisini değiştirmesinden dolayı MDAMB231 hücrelerinin ekstravazasyonuna izin verse de, hipoksi sırasında normal oksijen seviyesi ve statik koşullara kıyasla hem statik hem de akış koşullarında matrikste daha az ekstravaze olan kanser hücresi gözlemledik. Ayrıca akışın, normal oksijen seviyesinde statik durum üzerinde ekstravazasyon mesafesini tetiklediği ve hipoksi durumunda meme kanseri hücrelerine kıyasla normal meme epitel hücrelerini akış yoluyla matrikste daha uzağa ekstravaze olduğu gösterilmiştir. en_US
dc.description.sponsorship TUBITAK (115E057) en_US
dc.format.extent xii, 55 leaves en_US
dc.identifier.uri http://standard-demo.gcris.com/handle/123456789/3726
dc.language.iso en en_US
dc.publisher Izmir Institute of Technology en_US
dc.rights info:eu-repo/semantics/openAccess en_US
dc.subject Breast cancer en_US
dc.subject Hypoxia en_US
dc.subject Normoxia en_US
dc.subject Metastasis en_US
dc.subject Extravasation en_US
dc.subject Microfluidics en_US
dc.title Evaluation of biophysical aspedts of cancer using lab-on-a chip devices en_US
dc.title.alternative Kanserin biyofiziksel yönlerinin yonga-üstü-laboratuvar aygıtları kullanılarak değerlendirilmesi en_US
dc.type Master Thesis en_US
dspace.entity.type Publication
gdc.author.institutional Tahmaz, İsmail
gdc.description.department Computer Engineering en_US
gdc.description.publicationcategory Tez en_US
gdc.oaire.accepatencedate 2019-01-01
gdc.oaire.diamondjournal false
gdc.oaire.impulse 0
gdc.oaire.influence 2.9837197E-9
gdc.oaire.influencealt 0
gdc.oaire.isgreen true
gdc.oaire.keywords Biyoteknoloji
gdc.oaire.keywords Biotechnology
gdc.oaire.popularity 2.03792E-9
gdc.oaire.popularityalt 0.0
gdc.oaire.publicfunded false

Files

Collections